No futuro próximo, a humanidade desapareceu, deixando uma grande megalópole desprovida de vida natural. Da destruição desperta ROSA, uma parte do robô do projeto KERNEL, a última tentativa da humanidade de restaurar o ecossistema terrestre usando amostras recuperadas de espécies de plantas extintas há muito tempo. Viajando entre as ruínas da cidade sem vida, Rosa logo descobrirá que ela não é a única parte do Kernel que despertou.