Quando são acidentalmente transportados para a Era Jurássica, as Tartarugas Ninja Mutantes Adolescentes precisam encontrar seu caminho através de dinossauros pré-históricos para retornar para casa enquanto enfrentam alienígenas perigosos do futuro que têm um plano nefasto para eles. Mas as coisas ficam ainda mais complicadas com a chegada de Triceratons, Bebop e Rocksteady.