O grupo de corsários conhecido como Blue Steel continua sua missão de entregar projetos do Vibration Warhead Torpedo - uma arma que pode virar a maré da guerra a seu favor - para os Estados Unidos. No entanto, uma nova ameaça surge de seu inimigo, a esmagadora Frota da Névoa na forma de "O Conselho Estudantil.,"Este é um grupo de naves de guerra composto pelos Modelos Mentais restantes - os avatares humanóides das naves - que ainda precisam enfrentar o imprevisível capitão do Blue Steel, Gunzou Chihaya. À medida que o Blue Steel se aproxima de entender as origens da autoridade que controla o inimigo, O passado de Iona começa a revelar por que a guerra começou e sua razão para se aliar à humanidade.